A Pied:
Les principaux points d'intérêt du Centre Historique de la ville peuvent être visités à pied, à partir de la gare Coimbra A, des principaux parcs de stationnement, et à partir des hôtels les plus centraux. La liaison entre la partie haute et la partie basse de la ville comporte, dans certaines rues, des dénivelés importants qui rendent difficile la montée. Les parcs et les jardins des rives du Mondego sont aussi des lieux agréables pour des promenades à pied. Dans la zone centrale, il existe une vaste zone piétonnière dédiée au commerce.
A bicyclette:
Le relief de la ville peut a priori décourager les parcours à bicyclette dans certains quartiers, mais dans certaines zones, riveraines du fleuve, et jusqu'au Choupal par exemple, il y a assez d'espaces plats pour pouvoir pédaler.
La Mairie prête des vélos pendant les week-ends dans le Parc Vert du Mondego, près des espaces verts.
En bateau:
Le "Basófias" offre des mini-croisières sur le fleuve. Il est possible aussi de louer des canots et des pédalos pour une promenade sur le fleuve.
En voiture:
La circulation dans Coimbra est assez fluide, mais le stationnement au centre est rare et normalement coûteux. Dans la zone de l'Université il est très difficile de trouver où stationner. Pour un séjour assez court il est recommandé d'utiliser un des stationnements souterrains du centre-ville. Pour un séjour plus long, les parkings près du fleuve, notamment sur la rive gauche, sont gratuits.
En taxi:
Coimbra dispose d'un service de taxi, d'une centrale-radio. Le tarif comprend un tarif fixe au départ avec un supplément qui dépend du parcours et de la distance parcourue.
Transports Urbains:
Coimbra dispose d'un bon réseau de transports urbains, avec des tickets à la journée pour les touristes. Il existe aussi le Funtastic, un autocar panoramique qui parcourt les principaux points touristiques de la ville.